Je redni profesor na ljubljanski univerzi (Fakulteta za družbene vede – FDV, Pravna fakulteta) in na Univerzi na Primorskem (Fakulteta za humanistične študije Koper – FHŠ), kot profesor predava na univerzah v Bosni in Hercegovini, Italiji, Južni Afriki in Madžarski, kot gostujoči predavatelj pa je predaval tudi v drugih evropskih državah ter v Avstraliji, Kanadi, Novi Zelandiji in ZDA. Na FDV koordinira magistrski podiplomski program Politologija – Etnične študije: Urejanje in upravljanje medetničnih odnosov in konfliktov ter na FHŠ doktorski program Upravljanje različnosti, ki se začenja izvajati 2010 in naj bi postal del skupnega evropskega doktorskega programa (Diversity Management and Governance), ki je nastal v sodelovanju z univerzama v Bolonji in Gradcu ter Novo bolgarsko univerzo iz Sofije. Poleg tega redno predava v več mednarodnih podiplomskih programih (med njimi tudi v skupnem evropskem magistrskem programu Erasmus Mundus o lokalni demokraciji in razvoju, ki ga koordinira Univerza v Trentu) ter na različnih mednarodnih poletnih šolah (npr. ISES, Univerza v Bolonji, itd) in programih (npr. eden od kodirektorjev »Divided soicieties« na Interuniverzitetnem centru v Dubrovniku).

Dr. Žagar sodeluje z različnimi državnimi institucijami (Ministrstvo za kulturo, Ministrstvo za zunanje zadeve, itd.), z nevladnimi organizacijami in z mednarodnimi organizacijami (ZN, Svet Evrope, OVSE, Visoki komisar OVSE za narodne manjšine, itd.), med drugim pa je bil (2001–2003) tudi vodja Delovne skupine za človekove pravice in manjšine Pakta stabilnosti za JV Evropo.

Področja raziskovalnega interesa

Primerjalno ustavno pravo; Primerjalni politični sistemi in politike; Mednarodno javno pravo (posebno človekove pravice in sosedsko pravo); Mednarodni odnosi; Človekove pravice; Politične vede (politologija); Državljanska vzgoja; Etnične študije; Študije konflitkov in mirovne študije; Upravljanje različnosti; Preprečevanje, upravljanje in razreševanje kriz in konfliktov
 

Izbrana bibliografija

• Žagar, Mitja. »Strategies for the Prevention, Management and/or Resolution of (Ethnic) Crisis and Conflict: The case of the Balkans.« V SANDOLE, Dennis J. D. (ur.), BYRNE, Sean (ur.), SANDOLE-STAROSTE, Ingrid (ur.), SENEHI, Jessica (ur.). Handbook of conflict analysis and resolution. London; New York: Routledge, 2009, str. 456–74.
  
   
• Žagar, Mitja. »Diversity management and integration: From ideas to concepts.« European yearbook of minority issues, Vol. 6, 2006/7 (edited by: BLOED, Arie, HOFMANN, Rainer, MARKO, Joseph, MAYALL, James, WELLER, Marc, ÅKERMARK, Spiliopoulou & PACKER, John (eds.); Leiden; Boston: Brill, 2008), pp. 307-327.

• Žagar, Mitja. Human and minority rights, reconstruction and reconciliation in the process of state- and nation-building in the Western Balkans . V European yearbook of minority issues. - ISSN 1570-7865. - Letn. 7 (2007/2008), str. 353-406.
  
   

• Žagar, Mitja. Diversity management - evolution of concepts. V Brezigar, Sara (ur.), Lavskis, Peter (ur.), Solem, Knut Erik (ur.), Žagar, Mitja (ur.). International, constitutional, legal and political regulation and management of ethnic pluralism and relations, including prevention, management and/or resolution of crises and conflicts as components of diversity management: tematic issue, (Razprave in gradivo, št. 52, 2007). Ljubljana: Inštitut za narodnostna vprašanja, 2007, 2007, št. 52, str. 6-37.

• Žagar, Mitja. The collapse of the Yugoslav federation and the viability of asymmetrical federalism. V Ortino, Sergio (ur.), Žagar, Mitja (ur.), Mmastny, Vojtech (ur.). The changing faces of federalism: institutional reconfiguration in Europe from East to West, (Europe in change). Manchester, UK; New York: Manchester University Press; New York: Distributed exclusively in the USA by Palgrave, 2005, str. 107-133.

• Klemenčič, Matjaž, Žagar, Mitja. The former Yugoslavia's diverse peoples: a reference sourcebook, (Ethnic diversity within nations). Santa Barbara, Ca.: ABC-CLIO, 2004. XX, 426 str., ilustr. ISBN 1-57607-294-0. ISBN 1-85109-547-0.
• Žagar, Mitja. Nekateri novejši trendi razvoja varstva manjšin in (posebnih) pravic narodnih in drugih manjšin: evropski kontekst = Some newer trends in the protection and (special) rights of ethnic minorities: European context. V: POLZER, Miroslav (ur.), KALČINA, Liana (ur.), ŽAGAR, Mitja (ur.). Slovenija & evropski standardi varstva narodnih manjšin, (Zbirka Slovenija in Svet Evrope, št. 21). Ljubljana: Informacijsko dokumentacijski center Sveta Evrope pri NUK: Inštitut za narodnostna vprašanja: Avstrijski inštitut za vzhodno in jugovzhodno Evropo, 2002, str. 71-81+77-104.

• Žagar, Mitja. Civic education and education for citizenship: continuous education for democracy in multicultural societies. V Luthar, Oto (ur.), Mcleod, Keith A. (ur.), Žagar, Mitja (ur.). Liberal democracy, citizenship & education. Oakville (Ontario); Niagara Falls (NY): Mosaic Press, 2001, str. 283-299.

• Žagar, Mitja. Ethnic relations, nationalism, and minority nationalism in South-Eastern Europe. V Keating, Michael (ur.), Mcgarry, John (ur.). Minority nationalism and the changing international order. New York: Oxford University Press, 2001, str. 325-341.

• Žagar, Mitja, Novak, Aleš. La protección de las minorías nacionales en la Europa Central y del este a través del derecho costitucional e internacional. Hum. iura, No. 8/9 (1998/1999), str. 19-68.

• Žagar, Mitja. Nationality, citizenship and protection of ethnic minorities: the case of the Republic of Slovenia. V STERN, Brigitte (ur.). Dissolution, continuation and succession in Eastern Europe. The Hague; Boston; London: Martinus Nijhoff: Kluwer Law International, 1998, str. 119-144.

• Žagar, Mitja. Rights of ethnic minorities: individual and/or collective rights? : some new(er) trends in development and the (universal) nature of human rights - the European perspective. J. int. relat. (Ljubl.). [Eng. ed.], 1997, vol. 4, no. 1/4, str. 29-48.

• Žagar, Mitja. National sovereignty at the end of the twentieth century: relativisation of traditional concepts; the case of Slovenia. V BUČAR, Bojko (ur.), KUHNLE, Stein (ur.). Small states compared: politics of Norway and Slovenia. Bergen: Alma Mater, 1994, str. 235–252.  

Izpis celotne bibliografije (Cobbis)